现代植物保护学科发展的总趋势是朝着微观、宏观两个方向发展，在宏观指导下同时进行微观研究，并将微观资料进行宏观分析和处理，不断发展病虫治理新理论和新技术。在宏观方面，应用生态学和系统工程学的原理和方法建立农业生态系统中病虫害监控决策体系;在微观方面，以分子生物学和基因工程的理论和技术为基础对病虫灾变机理进行分析，并为决策提供依据。21世纪植物保护学科的发展必将为建立有利于提高农业的综合生产能力，保护生物多样性，控制环境污染和节约能源的植物保护技术提供理论知识和技能，为农业的可持续发展和生态环境的保护提供保障。
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